岳飞在一天之内接连收到十二道用金字牌递发的班师诏。宋高宗发十二道金牌的时间，大约是在七月十日左右，即他得到七月二日克复西京河南府捷报不久。 岳飞收到如此荒唐的命令，愤惋泣下，“十年之功，废于一旦。”然而友军已经撤退，岳家军孤军难支，不得不下令班师，百姓闻讯拦阻在岳飞的马前，哭诉说担心金兵反攻倒算：“我等戴香盆、运粮草以迎官军，金人悉知之。相公去，我辈无噍类矣。”岳飞无奈，含泪取诏书出示众人，说：“吾不得擅留。”于是哭声震野。岳飞决定留军五日，以便当地百姓南迁，“从而南者如市，亟奏以汉上六郡闲田处之。” 岳飞父子被秦桧以谋反罪名予以逮捕审讯，由于找不到证据而无审讯结果，最终秦桧以“莫须有”的罪名（韩世忠当面质问秦桧，秦桧回答“其事体莫须有（莫须有三字的意思至今仍有争议，一说为“难道没有吗”，另一说为“也许有”）”）。绍兴十一年农历十二月廿九（1142年1月27日）除夕之夜，一代名将岳飞在杭州大理寺狱中被杀害，其长子岳云及其部下张宪斩于临安闹市。岳飞被害前，在狱中写下绝笔字：“天日昭昭，天日昭昭”岳飞被害后，狱卒隗顺冒了生命危险，将岳飞遗体背出杭州城，埋在钱塘门外九曲丛祠旁。隗顺死前，又将此事告诉其儿，并说：岳帅精忠报国，今后必有给他昭雪冤案的一天！岳飞沉冤21年后，绍兴三十二年（1162年），宋孝宗即位，准备北伐，便下诏平反岳飞，谥武穆，改葬在西湖栖霞岭，即杭州西湖畔“宋岳鄂王墓”，并立庙祀于湖北武昌，额名忠烈，修宋史列志传记。