先天性生殖器官发育不良甚至畸形是小儿最常见的一类疾患。如男孩有隐睾、包茎、睾丸鞘膜积液、尿道上裂或下裂、阴茎包皮过长等；女孩则以肛门阴道瘘、小阴唇粘连、两性同体等为多见。这些疾患往往因为缺乏明显症状而不被父母所重视，不仅延误治疗，影响孩子一生的生活质量，甚至有可能发展成恶性疾病而危及生命。

但大多数人认为男性生殖健康仅仅是一个成人话题，当孩子会走路以后，年轻的母亲往往将注意力更多地放在孩子的穿着打扮上，而忽视了孩子的生殖健康。男孩的包皮过长等疾病是幼儿时期较为常见的生殖器方面的疾病，如果家长不能及时发现并早期治疗，就会引起严重的后果。因此，专家告诫家长：男性生殖健康应从娃娃抓起。

性早熟也是现代社会出现的幼儿生殖健康问题中的一种。营养过剩、滥用保健品、生长速度加快、环境污染导致生殖器官发育异常。大众传媒的影响也使得儿童早熟现象日益严重，其中以女孩多见，为男孩发病的4～5倍。