孩子太小了，建议还是选择金边吧，别去暹粒了。
如果是成人的话，我肯定推荐暹粒，有博物馆，有洞里萨湖，有各种著名的宫殿庙宇，历史、文化、自然风光都有。相比之下，金边的景点少很多，市区内也就是金边皇宫、金边国家博物馆、独立纪念碑，金边郊区有监狱博物馆、杀人场等。市区内逛景点对小孩子来说总体还好，因为基础设施比郊区要好，能更好地满足小孩子需求。暹粒的景点基本也都在郊区，而且寺庙对小孩子来说估计没有任何吸引力。
所以综合来考虑，还是金边吧。只是如果一个人带孩子，一定注意安全。金边有时会有飞车党抢劫，一定要注意财物安全。

带着3岁的小孩如何选择合适岛

虽然作为有宝宝的人，我不太认同太早带宝宝去马代旅游，毕竟得让小孩从小明白赚钱难这个道理。如果说题主实在想把自己的宝宝带去马尔代夫享受高端酒店，我个人不建议住水屋，毕竟水屋对小孩而言有溺水危险，因此住沙屋更适合亲子出行。至于选岛，建议题主先上官网了解一下带小孩是否需要额外收取餐费及加床费（这些可以通过发邮件咨询到的）；如果题主想玩的尽兴，不想让照顾小孩耽误游玩，也建议题主留意一下意向岛是否有照看小孩的类似幼儿园的场所的地方（最好有中文幼师的），毕竟有了宝宝以后，一切都得以他为中心了，我个人深有体会，尤其在国外人生地不熟的地方，带子女出行的确有点影响出行。最后希望题主能在国外平平安安，旅途愉快。